大道至简 MS建模教程三步法

第一步：创建工程

（1）双击图标    启动Accelrys Materials Studio，出现一个欢迎界面Welcome to Material Studio，选择Create a new proj（创建一个新工程）。

（2）点击确定，选择新工程保存路径，自行命名，点击OK。

注意：新工程可保存在任意硬盘，但是必须保证文件路径为全英文，若存在中文字符，则会出现以下错误（如图1）。

图1. 错误提示信息

第二步：建立分子模型

法一：从数据库中导入分子（以苯为例）。

（1）选择File> Import> structures> organics > benzene导入苯分子结构。

（2）选择View> Display Style，选择Ball and stick以球棍模型显示。

图2. 苯分子结构（球棍模型）

法二：手动构建分子结构（以1-丁烯为例）。

（1）选择File> New> 3D Atomistic，点击确定。右击Project Explorer中的文件名3D Atomistic选择Rename重命名为1-butene。

（2）在工具栏    中选择Sketch Atom> C原子，然后在文档区域绘制C链骨架，并以球棍形式显示。

图3. 碳链骨架

（3）选中C1-C2键，在工具栏    中选择Modify Bond Type> Double Bond。

图4. 双键碳骨架

（4）在工具栏   选择Adjust Hydrogen自动添加H原子，在工具栏   选择Clean调整分子结构，1-丁烯分子构建完毕。

图5. 1-丁烯

第三步.建立表面模型（以Cu(110)为例）

（1）打开路径File> Import> Structures> metals > pure-metals> Cu，导入Cu的晶胞（见图6）。

图6. Cu晶胞

（2）选择Build> Surfaces> Cleave Surfaces打开对话框，在（hkl）处输入要建立的晶面（比如：110），点击Cleave（注意：表面厚度要大于cut-off distance的值）。

图7. 切面

(3) 选择Build> Crystals> Build vacuum slab，点击Build。（通常设置Vacuum thickness在10Å以上）。

图8. 建立真空层

（4）选择 Build> Supercell，输入A 、B 、C的值（如441），得到想要的超晶胞；选择Build> Bond，点击Calculate成键。

（5）选择Build> Crystals> Rebuild Crystal，选择1 P1，点击Rebuild。以球棍模型显示，即得到Cu(110)面。

图9. Cu(110)面

本文由材料人专栏科技顾问供稿。

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